Setsuna Mudô est un jeune délinquant de 16 ans , torturé par l'amour impossible qu'il voue à sa soeur Sara .
Il passe son temps à faire des conneries avec son meilleur ami Kira qu'il considère comme son grand frère .
Sestuna se fait souvent embêter à cause de ses cheveux châtains et de ses yeux marrons . En effet les autres étudiants sont jaloux de lui . Cette particularité vient de ses origines anglaises du côté de sa mère . Cette dernière ne peux d'ailleurs pas le supporter car elle a senti la différence de son fils et a décidé de l'éloigner de Sara . C'est pour cette raison que Setsuna vit chez son père .

Un jour une jeune démone , Kourai , annonce à Setsuna qu'il est la réincarnation de l'ange supérieur organique Alexiel , qui autrefois participa à la rébellion contre les cieux . Mais il n'en croit pas un mot .
Pendant ce temps un étrange jeu vidéo portant le nom d'Angel Sanctuary commence à causer de nombreux suicides .

! Attention spoilers !

Setsuna à la particularité de ne pas supporter la vue du sang ce qui l'empêche de tuer . Mais un jour Kato , qui est sous l'emprise de Rochel , tue Kira . Setsuna entre dans une rage folle et laisse Alexiel l'ange guerrière prendre le dessus et se débarasse de Kato . Kira qui est immortel se régénérera et se fera accuser du meurtre à la place de son ami.

Malgré tous les tabous qui pèsent sur eux , Setsuna finira par avouer son amour à sa soeur et ils s'enfuiront ensemble .
Mais lorsqu'ils décideront de revenir à Tokyo une apprentie ange tentera de tuer Setsuna mais c'est Sara qui se sacrifiera à se place . Ne pouvant supporter la mort de sa soeur bien-aimée , il va révéler la puissance d'Alexiel et entamer la destruction de Tokyo . C'est alors que l'ermite sacré , Adam Kadamon , appelée également Séraphita , apparaît et explique à Setsuna qu'il est l'ange salvateur qui doit empêcher l'Apocalypse et défaire l'armée des anges .

Setsuna accepte sa mission mais il veut d'abord sauver Sara . Adam Kadamon lui dit alors qu'il doit aller la chercher en Hadès le royaume des morts , mais pour cela il doit se planter le Glaive Divin en plein coeur , son corps restera en vie pendant sept jours si personne ne retire la dague avant . Le corps est emmené à l'abri dans le royaume de Kourai , l'Anagura le premier niveau des enfers où vivent les survivants des démons . En attendant , le temps sur Terre sera arrêté .

L'âme de Setsuna descend donc en Hadès , là il va être guidé par Kato qui essayera d'abord de le tuer pour se venger puis il lui viendra finalement en aide et deviendra même un de ses meilleurs amis .
Setsuna combattra Uriel et le libérera de son masque persona , il pardonne alors à l'archange de la terre la malédiction qu'il avait lancé sur Alexiel et lui dit qu'il n'a plus à se sentir coupable . Uriel explique alors que l'âme de Sara a été emmenée dans le monde céleste par Zahikiel le maître des trônes .
Il n'en faut pas moins à Sestuna pour décider d'aller faire un petit tour au paradis . Mais alors qu'il tente de rejoindre la sortie , un démon appelé Bavard retire par inadvertance la dague du corps de Setsuna .
Privé de sa véritable apparence l'âme de l'ange salvateur rejoint son premier corps , celui d'Alexiel qui était conservé également dans l'Anagura .

Setsuna veut à tout prix récupérer son ancien corps mais pour cela il doit contacter Raphaël la maître des Vertus , seul personne capable de le réssuciter .
Mais en attendant il faut mettre le corps à l'abri , Setsuna et Bavard se rendent donc sur Terre où ils sont attaqués par Mikaël qui a la ferme intention de se mesurer à l'ange salvateur . Mais Raphaël intervient est empêche Mikaël de se faire réduire en miettes .

Au même moment l'âme de Sara rejoint son véritable corps celui de l'archange de l'eau Gabriel .
Kourai accepte pour sa part de devenir l'épouse de Lucifer le prince des ténèbres en échange d'un remède pour ressuciter le corps de Setsuna .

Setsuna décide de sauver Kourai , mais avant il veut utiliser le remède mais ce dernier explose avant qu'il ressuscite son corps .
C'est décider , Setsuna se rend en enfer et après de nombreux problèmes réussi à sauver Kourai .

Pendant ce temps Kato qui a prit provisoirement l'apparence de Setsuna provoque Mikaël . Ce dernier rapplique sur Terre sans plus tarder en compagnie de Raphaël et de Gabriel qui essaye de comprendre ce qui lui arrive . Alors qu'il sont réuni autour du corps de Setsuna , Uriel apparaît et avec l'aide de Kato emprisonne tout le monde dans une bulle , la condition pour les libérer est que Raphaël ressuscite le corps de Setsuna . Il y arrive avec l'aide de Gabriel .
Mais alors que Setsuna se réveille , la bulle qui protégeait tout le monde est détruite par un intrus les amis sont alors séparés . Setsuna qui a compris que Gabriel est en fait Sara lui demande de l'attendre . Raphaël , Mickaël et Gabriel retourne au ciel , Uriel en Hadès , Kato et Setsuna partent retrouver Kira et Kourai en Anagura afin de mettre au point un plan pour ramener Sara .

Setsuna , Kato et Kira se rendent au cieux où ils rencontrent Zahikiel qui aide Setsuna à retrouver Gabriel .
Mais au moment où les deux amoureux pouvaient partir ensemble Gabriel décide de rester pour secourir quelqu'un qui l'a aidé . Suite à ce geste Setsuna de retour auprès de ses amis en Anagura comprend qu'il doit dorénavant arrêter d'être égoïste et accepter son rôle d'ange salvateur .

Setsuna est un personnage attachant et il surement celui qui évolue le plus au cours du manga , en plus il ne manque pas d'humour et a un design trés soigné ce qui fait lui un exellent héros .